马英九因特别费案遭贪污罪嫌起诉，成为参选2008提名后的绊脚石。国民党党章研修小组经研商后，确定要透过修改“排黑条款”替马解套。将原先党章规定一审有罪判决不得参选，大幅放宽为“经法院判决有罪确定者”才不得参选。
据台湾《中国时报》报道，据党章研修小组成员表示，这项修改极为敏感深怕影响社会观感，不少党内人士建议，应维持原条文一审有罪认定，以增订但书条文方式解套，也就是：如遇“政治迫害”，以召开“全代会”方式进行补救。
不过，据了解，党内仍以持直接放宽“排黑条款”的意见较多。但为顾及舆论声浪，放宽“排黑条款”后也增列“党员触犯列举之罪，在未经法院判决有罪确定前，如经廉能委员会或中央考纪会认定有害社会公义、有损本党声誉者，得撤销其参选资格�！�
党章研修小组成员认为，原本“排黑条款”的目的在树立清廉改革形象，与黑金画清界线；但现阶段却成为民进党政府利用司法，打压国民党的最佳工具，党内不能不防。
